睡到半夜肛门胀痛疼醒，考虑是肛周脓肿引起。肛周脓肿最常见的原因是肛窦炎，多由大肠杆菌及混合菌感染，早期表现为肛门部位肿胀、疼痛，为持续性钝痛，可伴有寒战、高热，病变部位皮肤变红，可以触诊到质硬的肿块，局部皮温增高，此时可以温水坐浴或者中药熏洗，每日两次，每次20分钟，静脉输液应用抗菌药物，可以选择头孢类药物、喹诺酮类药物以及甲硝唑、奥硝唑等药物，炎症控制后疼痛即可消失，体温降至正常。如果炎症未得到控制，会出现化脓，表现为跳动性疼痛，肿块触诊有波动感，此时需要手术治疗，行脓肿切开引流术或者根治术。
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