自身免疫性肝炎和其他的肝炎之间，在临床表现上没有明显的区别。患者也是有乏力，与肝功能受损的情况轻重有关，同时会伴有食欲减退、厌吃油腻食物。严重的患者会有恶心、腹胀、肝区不适或者肝区疼痛，也有些患者会有皮肤、巩膜的黄染、浓茶水色尿。对于这样的表现，就要进一步做检查，不能通过症状判断肝损伤的原因。
对于自身免疫性肝炎的患者，做肝脏相关的自身抗体检查，表现为抗核抗体水平升高，或者抗肝肾微粒抗体水平升高，同时会有免疫球蛋白中IgG水平的升高。这种情况下初步判断是自身免疫性肝炎，如果诊断得不是特别确切，可以做肝组织的活检。肝组织病理上，自身免疫性肝炎有特征性的表现，根据这些特点就可以作出判断，根据患者的情况，可以给出有效的治疗方案。
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