喉咙发炎不会影响核酸检测结果，如果采取咽拭子方法进行核酸检测，则会擦取受试者的咽部分泌物，新型冠状病毒肺炎感染者的分泌物中包含新型冠状病毒。所以在进行核酸检测时，会检查分泌物中有无新型冠状病毒特有的基因片段，如果结果呈阳性，受试者就是感染者，与喉咙部位发炎没有任何关系。
如果病毒感染引起炎症，也可能是细菌感染引起炎症，都不会影响患者分泌物中是否含有新型冠状病毒，所以也不会影响最后的检测结果。唯一可能的影响则是在取样过程中，即取咽拭子的过程中，棉签擦拭咽后壁和咽腭弓两侧时患者的不适感会更强，或者疼痛、恶心更加明显。
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