羟苯磺酸钙在应用的大部分人群中耐受性很好，一般很少发生不良反应。偶尔可以见到胃部不适、恶心的症状，有时会出现胃灼热感，以及食欲缺乏，还可能出现发热、出汗和面部潮红、心脏不适等症状，个别人也可能发生药物的过敏反应。
此外，国外有一些报道证明，其可能引起粒细胞的缺乏或者药物热的情况。羟苯磺酸钙本身是治疗微循环障碍的药物，大多数人群中使用效果良好，而并发症、副反应很少，如没有特殊的反应，通常可以进行长期口服。
