大脚趾的趾甲增厚很可能是甲癣，是一种真菌感染性疾病，给予趾甲屑做真菌培养，查到真菌阳性有助于诊断甲癣。甲癣通常先起于一个趾甲，其他邻近趾甲可以正常，如果没有及时治疗，其他趾甲有可能也会被传染。
甲癣的临床表现多为趾甲增厚，变成黄色或者棕色，趾甲下有碎屑，甲板可能有脆裂或者分离。有一些皮肤病也会导致趾甲出现增厚等异常，如银屑病、扁平苔藓、湿疹、硬皮病、连续性肢端皮炎等，但这些疾病导致的趾甲病变常波及多个趾甲，并对称分布。如果仅有一个趾甲异常增厚，先考虑是甲癣，需要抗真菌药物治疗。
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