甲胎蛋白（AFP）是胚胎期的功能性蛋白，合成于卵黄囊、肝脏和小肠。在胎儿出生后一年，可以降为正常水平，并保持不变。当患者发生原发性肝癌的时候，约65%-80%的病人血清中甲胎蛋白的含量会显著性升高。
对于其他的消化道肿瘤，如胃癌、结直肠癌、胆管细胞癌和胰腺癌的时候，也可以引起甲胎蛋白水平的升高，但是转移性肝癌却很少出现甲胎蛋白升高的状态。除了恶性肿瘤以外，病毒性肝炎、肝硬化患者的甲胎蛋白，也可以出现不同程度的升高，但水平没有恶性肿瘤高。对于部分生殖系统肿瘤、胚胎性肿瘤，血清中也可以看到甲胎蛋白升高的表现，临床上甲胎蛋白的正常值为0-25μg/L。
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