房颤消融术的危害是部分并发症，如穿刺部位出血、血肿，或者房颤复发，但都可以通过后期药物或者再次干预治疗。房颤对人体的危害较大，一旦心脏不正常跳动形成心房纤颤，血流会在心脏里形成湍流，从而形成血栓。血栓一旦脱落，脱落到脑、内脏动脉或四肢动脉，就会造成相应部位栓塞，对人体造成危害引起病症，严重会威胁患者生命。所以，患者患有房颤后需要积极治疗。
目前非常有效、临床中广泛使用的治疗方法是房颤射频消融术，是微创介入的办法，通过微创介入，把射频消融电极置入到心脏相应房颤异常搏动的部位，应用机器射频消融兴奋点，从而达到治疗的目的。通过治疗可恢复正常心脏跳动，从而满足人体的血液供应。所以一旦患有房颤，危险担心做射频消融的危害，应该积极进行治疗。
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