肺孢子菌肺炎是机会性感染疾病，肺孢子菌是在哺乳动物和人的呼吸道发现的单细胞真菌属，以往称为卡氏肺囊虫，肺孢子菌肺炎的感染途径为空气传播和体内潜伏状态胞子菌的激活，潜伏期一般为两周，艾滋病人潜伏期约四周，发病无性别和季节差异，在不同个体及疾病的不同病程，肺孢子菌肺炎临床表现差异甚大。
肺孢子菌肺炎的散发型或现代型多见于免疫缺陷者，偶见于健康者。化疗或器官移植病人并发卡肺孢子菌肺炎时病情进展迅速，而艾滋病人并发时的进展较缓慢，初期表现有食欲缺乏、体重减轻，继而出现干咳、发热、发干、呼吸困难，很快发生呼吸窘迫，未及时发现和治疗的病人，其病死率高达70%-100%。此病的病人常表现症状和体征分离现象，即症状虽重，体征常缺如，少数病人可有数次复发，尤其在艾滋病病人中更为常见。
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