肝结石如果严重的时候会导致肝脏出现萎缩、肝硬化、肝脓肿，甚至肝内胆管癌的发生，具体要根据肝结石严重程度以及持续时间。某些情况下如果肝结石合并出现严重的症状，需要早期的手术治疗，因为严重的肝萎缩属于一种癌前病变，持续的存在会导致出现胆管癌。
所以肝结石如果是少量的，没有明显的症状，也没有引起肝脏的异常改变，可以先观察，饮食以低脂肪、低胆固醇为主，禁忌烟、酒，但如果肝结石的数量较多，并且反复的出现症状，或者引起肝脏的异常改变，如肝萎缩、肝脓肿、肝内感染，建议早期手术治疗，以预防后期出现癌变的风险。
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