中段尿培养的意义在于检测，是由于何种致病菌感染所导致的尿路感染。对于指导尿路感染的治疗是至关重要的，因为近年来尿路感染当中出现的耐药菌群越来越高，尤其是ESBL阳性的肠杆菌属的检出率越来越高。这一类的细菌感染，普通的一线抗生素治疗往往效果不佳，通常使用的左氧氟沙星或者一般的头孢类抗生素，往往是耐药的。在治疗中就应该根据中段尿培养的培养结果，以及药敏试验的结果来选择敏感的抗生素治疗，才能达到比较好的治疗效果。ESBL阳性的肠杆菌属的治疗，常常需要使用带有β-内酰胺酶抑制剂类抗生素，比如哌拉西林他唑巴坦或者头孢哌酮舒巴坦等，严重的耐药菌甚至需要使用炭青霉烯类抗生素治疗。
