黑质是大脑脚底与中脑被盖之间的灰质团块，见于中脑的全长。黑质细胞富含有黑色素，是中脑内合成多巴胺的重要的核团。黑质主要与端脑的新纹状体有往返的纤维联系，这个新纹状体包括尾状核和壳核。由于某些原因使黑质细胞变性，多巴胺形成减少，就会引起震颤、麻痹，也就是帕金森病。
在正常的生理状态下，黑质是调节运动的重要中枢。黑质致密部多巴胺神经元的凋亡可以导致帕金森病，这种疾病可能与遗传因素有关系，也有可能是某些不明的原因造成，而多巴胺神经元的病变也可能与精神分裂症以及某些焦虑、抑郁症的症状有关系。
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