儿童梗阻性脑积水的预后比成人好。因为儿童的大脑还处在发育的阶段，受到外力的压迫会变薄，特别是脑皮层变薄，一旦解除了外在的压力，脑皮层可以重新长出来。但要根据孩子不同的年龄阶段，年龄越小再生能力越强，年龄越大再生能力越弱。所以儿童梗阻性脑积水的治疗效果比较好，其长期的预后也比较好。对于梗阻性脑积水的孩子，建议及早进行手术治疗。
在做手术的选择上，要选择确切有效的治疗方法，可以做分流或造瘘。如果选择的手术不确切，未起到引流作用，脑积水的压力可能长期存在，脑部发育会受影响。所以要及时的把脑积水排出，使脑部压力得到缓解。
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