临床工作中，因为甲状腺良性结节前来就诊的患者较多，治疗办法无外乎定期复查、手术或者非手术治疗。
定期复查：多数良性结节，无需特殊治疗，可每隔6-12个月随诊一次;可疑结节，复查时间可缩短。临床检查如伴有声音嘶哑、呼吸/吞咽困难，结节固定、颈淋巴结肿大，结合颈部超声，必要时结合甲功五项，超声下穿刺，多数可达到复诊要求。如结节生长较快，一般指结节体积增大50％以上，或者超声检查发现至少2条经线增加超过20％(至少超过2mm)，存在FNAB的指征，也就是超声引导下细针穿刺，明确病理，或者伴有超声下的恶性征象，可考虑手术。
手术治疗：以下情况可考虑手术：局部压迫症状;合并甲亢，口服药物治疗无效;胸骨后甲状腺肿;临床考虑有恶变或伴有甲状腺癌高位因素;外观肿大、思想顾虑过重、影响正常生活并强烈要求手术者。
由于切除了全部或者部分甲状腺组织，术后多存在不同程度的甲减，伴有甲状腺过氧化物酶抗体或者甲状腺球蛋白抗体增高者，更易出现甲减。甲状腺全切除的患者，术后即应开始口服优甲乐，要定期监测甲功，保持TSH水平在正常范围。部分切除者，术后可结合甲功情况和保留腺体的多少，口服优甲乐;或者术后1个月复查甲功，出现甲减，及时给予优甲乐替代治疗。
良性甲状腺结节术后，不建议采取TSH抑制治疗来预防结节再发。
非手术治疗：不建议常规使用口服优甲乐抑制疗法治疗甲状腺结节;对于一部分年轻患者，如果是小的多发结节性甲状腺肿，可考虑采用TSH抑制治疗，但要是部分抑制，也就是TSH值在0.4-0.6之间。
碘131主要治疗有自主摄取功能并伴有甲亢的甲状腺结节。对那些甲状腺有自主摄取功能但不伴甲亢的结节，碘131可以考虑。治疗后也要每年复查一次甲功，防止出现甲减。不适用有压迫症状或者胸骨后甲状腺肿以及妊娠期、哺乳期的妇女。
其他如超声引导下经皮无水酒精注射，对甲状腺良性囊肿或者含有大量液体的甲状腺结节有效。经皮激光消融术、射频消融等，治疗前，先要排除恶性的可能性。
