乙肝e抗原阴性不能单独说明一个指标，因为有很多种可能情况，需要从整个乙肝五项中得出整体情况。当e抗原阴性的同时，要看乙肝五项的其它几项表现，比如乙肝五项全部是阴性，因此e抗原也是阴性，上述情况提示需要注射乙肝疫苗。对于乙肝感染的说法，人是一张白纸，但仍然将来可能会被感染，所以通常建议注射乙肝疫苗，按0、1、6的顺序打3针，产生保护性抗体。
如果e抗原阴性由原来的e抗原阳性转变，比如最典型情况，乙肝五项从1、3、5阳性变成1、4、5阳性，其中3是指e抗原，也是第三项e抗原转阴，而第四项e抗体转成阳性，叫从大三阳变成小三阳，也叫e抗原的血清转换，上述转换过程有可能发生在慢性乙肝患者抗病毒治疗过程中。如果发生上述情况，通常认为是一种积极的转变，说明抗病毒效果达到阶段性胜利，治疗效果挺好。
还有一种情况是可能没有抗病毒的人，自然病程中随着时间延长和随着年龄增长，大三阳会变成小三阳，e抗原也会从阳性转为阴性。有时代表病毒的自发清除是好的转变，但有时仅仅随着年龄增长，病毒自然而然的转变，不一定伴随病情好转。所以要结合其它一系列的肝脏相关检查，判断具体情况。
