SCC最初从宫颈癌组织中分离获得，是一种丝氨酸蛋白酶抑制剂，是一种特异性高的主要用于诊断鳞癌的肿瘤标志物。
SCC分布于全身正常组织的鳞状上皮细胞内，因此正常外周血中含有一定范围的SCC水平。但随着鳞状上皮细胞的恶性增殖，细胞内SCC被迅速释放入血，从而引发外周血SCC的升高。因此，SCC对于所有鳞状上皮细胞起源癌的诊断和监测具有一定意义。例如：宫颈鳞癌、肺鳞癌、食道鳞癌、口腔鳞癌、鼻咽癌、膀胱癌、肛管癌、皮肤癌等。
对于已经发现的上述肿瘤，SCC的浓度变化与其治疗的疗效、病情的复发、转移和进展，以及预后的评估存在密切关系：
临床上SCC水平的异常升高，应重视并警惕上述肿瘤对发生：一旦出现SCC水平的异常升高，首先需要重复抽血再进一步复查，以除外实验室误差所致：如果仍高，就需要进一步身体全面检查，以及影像学的检查，如胸腹盆腔增强CT检查。经济条件许可者，也可以直接进行全身的PET-CT检查。SCC异常升高，往往提示有病灶存在，PET-CT检查能够最早发现病灶。早期发现，早期治疗，疗效会更好。
临床上SCC有可能先于症状和体征数月前出现，因此即便是影像学未发现异常，也要严密随诊监测SCC的变化：SCC仅仅提示体内存在发生鳞癌的风险，需要进一步确诊，需要影像学及病理学的诊断。
SCC在监测肿瘤的复发同样有着重要的临床意义。
