先天性手部畸形的手术治疗主要包括畸形矫正和功能重建两个方面。此外，还能控制和延缓畸形的发展。
合理选择手术时机需要进行综合性考虑，如患儿年龄、发育、心理、病情、是否合并身体其他部位的畸形、手术者的临床经验和技术、麻醉及手术中和手术后的监护水平等因素。一般认为，一个复杂的先天手部畸形的治疗最好是在入学前完成，畸形比较简单者可在3-6个月前完成治疗。这样有利于患儿的心理发育，同时能减少手术后的局部疤痕残留，根据患儿病情和国内目前的医疗技术和设施等具体情况，多数先天性手部畸形的手术治疗可在1岁左右开始。
婴、幼儿时期的手术应考虑到畸形的组织结构细小，给修复手术带来困难，对医生的操作要求高，只有经过显微外科训练的医生才能胜任，同时需要精细的手外科及显微外科器械配合。所以，患者在诊治时一定要选择专业的手外科医生，而不是大骨科医生。
