支原体感染与衣原体感染的肺部的查体、胸片、血常规基本相似，不能够区分。如果患者的支原体抗体出现四倍以上升高，考虑为支原体感染，如果患者的衣原体抗体出现四倍以上升高，考虑为衣原体感染，是鉴别两者最主要的依据。患者确诊为支原体感染或者衣原体感染的治疗是相似的，可使用大环内酯类的抗生素或者喹诺酮类的抗生素，大环内酯类的抗生素包括罗红霉素、红霉素、阿奇霉素等，喹诺酮类的抗生素包括左氧氟沙星、莫西沙星、帕珠沙星等，使用上述药物时要注意药物的副反应及禁忌证。
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