植物神经功能紊乱发病的原因，主要是与社会心理因素关系比较大。比如患者在长期的精神紧张，压力过大，或者是精神方面受到刺激，容易出现植物神经功能紊乱的问题。还有一部分患者与遗传因素也有关系，比如患者如果家族有植物神经功能紊乱的问题，患有疾病的概率也是增加的。还有一些女性的患者，由于内分泌或者是在特殊的生理时期，也容易出现植物神经功能紊乱，比如在绝经的前后，容易出现更年期的综合征。还有就是其他的因素，比如营养代谢或者是精神等方面的刺激，都容易导致患者出现植物神经功能紊乱的症状。
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