肠易激综合征主要症状是腹痛，而且腹痛多在进水后出现，在排便以后多会缓解。再一个症状是腹胀，通常在午餐后会感觉强烈，夜间入睡以后会逐渐减轻。腹泻、大便有黏液、便秘，尤其是进食以后明显，大便以后仍有没有排干净感觉，也是肠易激综合征主要症状。旅行、改变日常生活规律、饮食不当，或者女性来例假时，上述症状都可能会加重。另外，部分病人可有不同程度心理精神异常表现，比如焦虑、抑郁、紧张等。
肠易激综合征可分为腹泻型，至少25%排便为糊状便或水样便，而且硬便或者干便小于25%。便秘型至少25%排便为硬便或者干球便，而且糊状便或水样便小于25%。混合型至少有25%排便为硬便或干球便，而且至少有25%排便为糊状便或为水样便，不定型是粪便性状不符合以上各型标准。
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