抗核抗体阴性说明体内不存在抗核抗体这种自身抗体，但是需要看检测方法以及灵敏度，因为任何检测方法都不能将所有抗体检测出来。抗核抗体有几十种不同的检测方法，检测的类型不同，敏感性不同，某些检测方法只能检测其中的十几种抗体。
抗核抗体阴性，只能说明目前此方法没有在体内检测出抗核抗体，在临床表现以及其他实验室检查高度怀疑患有自身免疫病时，需要进行其他相关自身抗体检查，如抗DNA抗体、抗核小体抗体、抗着丝点抗体等，可对病情进行早期的诊断。
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