桥本氏甲状腺炎主要是由于遗传背景，以及环境因素共同作用所引起，桥本氏甲状腺炎有一定的遗传倾向，如果家族中有桥本氏甲状腺炎的患者，通常这个家族的女性人群一定要关注是否有可能患有桥本氏甲状腺炎。
另外，环境因素、情绪应激，高碘和低碘的环境都是桥本氏甲状腺炎可能存在的诱因，主要是由于桥本氏甲状腺炎患者体内存在针对甲状腺的自身抗体，如抗甲状腺球蛋白抗体、抗甲状腺过氧化酶抗体，以及抗甲状腺微粒体抗体等等，这些自身抗体造成了甲状腺出现自身免疫性的炎症，有些患者由于这种自身免疫炎症破坏导致出现甲状腺功能减退症，所以桥本氏甲状腺炎在出现甲状腺功能减退症时，通常需要给予左甲状腺素钠片进行替代治疗。
