出现细菌性感染发烧，治疗有两方面：一方面要对细菌感染进行治疗；另一方面要对发烧给予对症处理。临床上用于治疗细菌感染的抗感染药物，包括青霉素类、头孢类抗生素，还有大环内酯类、喹诺酮类等药物。抗生素选择上先确定病原体，并尽可能的做细菌药敏试验，以供选用药物参考。对于轻度的感染，以口服用药为主。
抗感染药物通常应该持续用到体温正常、症状消退后的3-4天，如果用药后效果不显著，需要在48-72小时后考虑改药或调整剂量。关于发烧，对于体温超过38.5℃以上的病人，可选择药物退热，常用的药物有对乙酰氨基酚、布洛芬、吲哚美辛栓剂等，而对于低热的病人，可选择物理降温。
