抗甲状腺过氧化物酶自身抗体升高，具体的治疗方法要根据甲状腺功能。如果甲状腺功能正常，伴有甲状腺过氧化物酶抗体升高，通常不需要治疗，定期观察即可。如果甲状腺功能减退，同时伴有抗甲状腺过氧化物酶自身抗体水平升高，通常给予左甲状腺激素进行替代治疗。
如果抗甲状腺过氧化物酶自身抗体升高，同时伴有甲状腺功能亢进，需要结合TRAb的水平。如果TRAb是阴性，通常考虑是甲状腺毒症的可能性比较大。如果TRAb是阳性，考虑Graves病的可能性就比较大，可以给予药物、手术或者碘-131进行治疗。
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