艾滋病患者在进入到后期，也就是艾滋病的晚期，患者会因为病毒持续的复制，导致免疫功能极度低下。这时患者的CD4+T淋巴细胞计数往往会小于200每立方毫米，患者可以出现各种各样机会性感染。一旦进入这个时期，患者的平均生存期只有12-18个月，绝大多数患者会因为机会性的感染以及恶性的肿瘤而导致死亡。
因此，艾滋病一旦确诊之后应当尽快的使用抗病毒药物进行治疗，通过长期的服用抗病毒药物可以抑制病毒的复制，避免患者免疫功能的下降，避免进展到艾滋病期。患者可以长期的带病生存，可以将艾滋病控制到类似于高血压、糖尿病一样的慢性病。
