引起肺部感染的致病菌包括细菌、非典型病原体、病毒、真菌。细菌包括革兰氏阴性菌、革兰氏阳性菌、杆菌、球菌；非典型病原体包括支原体、衣原体、军团菌。病毒包括腺病毒、呼吸道合胞病毒、流感病毒等；真菌包括念珠菌、曲霉菌、隐球菌等。抗生素有很多种类，临床常用的有青霉素类、头孢菌素类、大环内酯类、喹诺酮类、氨基糖苷类等。
青霉素类又分为五类，头孢菌素类有一二三四代；喹诺酮类分为1-4代，每一种抗生素对应不同病原体，所以需要考虑的因素有很多，即使行医多年的医生也还在不断积累经验，都需要参考指南、共识，结合患者的病情决定如何用药。所以，如果患者出现肺部感染，建议由医生决定如何用药，切忌盲目用药，以免造成抗生素滥用，导致病原体耐药，增加治疗难度。
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