胎儿磁共振是孕期一种辅助的检查方法，一般并不把它常规用来评估胎儿的情况。但是在某些特殊的情况下，磁共振可以用来作为超声的补充检查手段。最主要用于胎儿先天发育畸形和肿瘤的诊断，比如说胎儿颅脑发育的异常、脑组织先天性的肿瘤或者是神经管闭合畸形等。另外，磁共振还能够对胎儿的腹部异常、胎盘异常进行评估，比如如果是前者胎盘可以通过磁共振，来判断胎盘植入的范围以及程度同。超声相比磁共振软组织的对比度比较好，能够更高质量的显示出胎儿的器官，更有利于评估胎儿是否存在解剖结构的异常。
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