先天性甲减一般不能治愈，先天性甲减即先天性甲状腺功能减退症，这种先天性疾病需要终身替代治疗。
先天性甲状腺功能减退症按病变部位可分为原发性和继发性。原发性甲状腺功能减退症即甲状腺本身的疾病所致，甲状腺先天性发育异常是最主要病因，其他病因有甲状腺激素合成障碍、甲状腺或靶器官反应低下等。继发性甲状腺功能减退症较为少见，病变部位在下丘脑和垂体﹐是因垂体TSH障碍所致，常见于特发性垂体功能低下或下丘脑、垂体发育缺陷。因此该病一旦确诊需要长期用药调控甲状腺激素水平。
先天性甲状腺功能减退症的治疗药物首选左甲状腺素，从小剂量开始逐渐增加剂量至最佳疗效。这种长期替代治疗者要注意监测体重、心功能等，防止甲状腺激素过量引起的骨质疏松、假性脑瘤或冠状动脉粥样硬化性心脏病恶化等情况发生。
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