口腔扁平苔藓的治疗，目前强调心理治疗的作用，因为很多患者可能是有心理状态、工作压力或者焦虑等导致。这些患者的扁平苔癣的症状不会很重，进行心理治疗之后有的患者还能够自愈。除了这种患者之外，对于普通的病变型的扁平苔藓，要进行局部的治疗，主要是发现局部的刺激因素，去除刺激因素后消除感染性的炎症，可以应用维A酸类的药物以及肾上腺皮质激素来进行局部的治疗。全身的治疗主要是应用免疫抑制剂，包括口服肾上腺皮质激素，以及雷公藤和昆明山海棠的应用，现在临床上也应用氯喹来进行抑制免疫治疗扁平苔藓。除了免疫抑制剂，还有免疫调节剂的应用，这都是针对免疫状态的治疗，也有中医中药来进行扁平苔藓的调理身体的作用，也没有经过明显的临床试验的研究，可以考虑使用。
