核酸阴性并不能完全排除新型冠状病毒肺炎的感染，尤其是对于有流行病学史的人要多次进行检验，因核酸检测存在假阴性的可能，对于有新型冠状病毒接触、有流行病学史的人群，高度怀疑新型冠状病毒肺炎感染，一次阴性并不能除外，需要多次采集，每个标本采集至少间隔24h以上。
核酸检测会受到病程、标本采集、检测过程、检测试剂等多种因素的影响，为了提高检测的阳性率，应标本采集规范，采集标本后立即送检，可以鼻拭子和咽拭子同时采集，以增加检测的阳性率，降低检测的假阴性率。在发病初期或者是无症状感染者，病毒含量往往较低，所以检测的假阴性率偏高。
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