怀孕早期有腹泻，这种情况要看是否伴有发热、腹痛等症状。如果只是单纯的腹泻，没有其他伴随症状，多考虑为功能性的腹泻，跟进食过饱或者肠胃的菌群失调有直接关系。可以用整肠生或培菲康等药物调节，补充多酶片对于消化不良引起的腹泻也有一定的效果。
如果病人表现腹泻外，还有发热、腹痛等症状，则要排除急性肠胃炎或胃肠型感冒的可能性，需要化验大便常规加血常规明确。在确诊后，这类的情况需要用头孢类的抗生素治疗，在拉肚子比较重时需要服用蒙脱石散止泻治疗。上述推荐的药物对于怀孕的胎儿都不会有影响。
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