残窦综合征是指B2式手术以后，胃窦切除不全，残留的胃窦所导致的吻合口溃疡症候群。残留胃窦复发性的溃疡，其发病率为40%，主要的原因是残留胃窦的黏膜，受到反流的碱性十二指肠液的刺激而产生大量的胃泌素。胃泌素经过吸收进入血液，作用于胃底部的黏膜，刺激残胃壁细胞，促使胃液发泌过多，胃酸过高，从而发生术后的吻合口溃疡。典型的症状是胃液分泌过多和吻合口溃疡所导致的一系列症候群。如长期、周期性、饥饿性的上腹部疼痛，可以有上腹部的烧灼感、反酸、嗳气等等。对于残窦综合征，一旦确诊，治疗上应当彻底切除残余的胃窦，并顺利行生理性的十二指肠通道，即B2式的手术改为B1式，如将胃与十二指肠直接做端端吻合或者游离空肠襻替代术，有人还同时做双侧的迷走神经干切除术。
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