磁共振属于影像学检查设备，而在影像诊断学方面，磁共振有着非常高的分辨率。因此在对于某些疾病的诊断方面，远优于其他的影像学检查方法。一般情况下，在其他如B超、CT等影像学检查，无法分辨的病变组织，多采用磁共振来做进一步检查，而磁共振特别对于内脏软组织的检查，具有绝对优势。另外对于肝癌、肺癌、胰腺癌等恶性肿瘤的诊断，采用加强的磁共振可做出定性诊断，在这方面增强CT也是做不到的。
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