雌孕激素对体温变化有一定影响，所以通过测定基础体温，可以了解月经周期的情况。其变化规律常常是在月经期以及卵泡期，基础体温是处于低温相，也就是比较低，而在排卵以后由于孕激素升高，则会出现体温升高的现象，低温相与高温相常常相差0.4-0.6℃。
如果没有受精，也就是没有怀孕，黄体会在14天萎缩，高温相持续14天会迅速下降，这时就会有月经来潮，我们将这种基础体温的变化称之为基础体温呈双相。这种情况月经正常，一般卵巢功能也正常，而这些体温的表现仅限于基础体温，也就是早晨在不吃、不喝、不动的情况下所测定的体温。
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