GFR低于15mL/min，或者波动于15-30mL/min，就可以进行病变肾脏的切除术。在临床上，因为人体有两个肾脏，一旦单侧的肾脏发生病变，功能逐渐丧失就需要进行肾脏的切除，最常见的疾病有：一、肾脏的巨大肿瘤；二、肾囊肿；三、肾积水；四、肾结核；五、肾外伤。
进行手术评估前都要进行GFR的测定，一旦表明已经基本或者完全丧失功能，就要进行肾脏的切除。通常情况下，在切除一个肾脏后，单侧的肾脏还可以维持正常的肾脏功能，但需要做好定期复查。
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