甲状腺功能减退症有可能造成关节的损伤。甲减是由于各种原因，使得甲状腺合成分泌甲状腺激素减少，或甲状腺激素不能充分发挥生理效应。甲状腺功能减退症可以造成关节的影响，可以出现非炎性的黏液渗出、软骨钙质沉着、关节破坏以及屈肌腱鞘炎。不仅可以造成关节的炎症，还可以造成肌肉的损伤，主要表现为肌肉软弱、乏力，也可以有暂时性的肌强直、痉挛、疼痛，咀嚼肌、胸锁乳突肌、股四头肌以及手部肌肉可以出现进行性的肌萎缩，还可以出现腕管综合征，由于腕管中黏蛋白物质在神经外堆积，引起手指疼痛或感觉异常。甲状腺功能减退对骨骼也有影响，特别是对青少年、儿童可以造成骨骼生长迟缓以及骨龄延迟，主要见于呆小症和幼年型甲状腺功能减退。
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