体内有很多类型的恶性肿瘤，有可能会引起鳞状上皮细胞癌（SCC）相关抗原偏高。像宫颈癌、肺鳞状细胞癌、食管癌等这些恶性肿瘤中，SCC水平升高的比例比较高。还有像卵巢癌、子宫癌和颈部鳞状上皮癌等这些恶性肿瘤中，SCC升高所占的比例比较少。但是SCC如果稍微高一点，有可能也是由体内的炎症引起的，并不能代表体内肯定有恶性肿瘤。相反，如果SCC的值在正常范围之内，也并不能代表体内就肯定没有恶性肿瘤。SCC在临床上主要用于监测上述恶性肿瘤的治疗效果，有没有复发，有没有转移等。
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