头皮屑产生的机制主要是头皮的生态平衡遭到了破坏。
实际上健康的头皮由三大平衡维持，油脂、菌群、代谢的平衡。当头皮的头皮屑分泌失衡，头皮就会出油变油腻。当头皮菌群的环境失衡，有害的菌群就大量的滋生，这就会出现头皮的瘙痒症状。而头皮的角质层代谢过快、脱落，这就会形成头皮屑。头皮作为人体重要的头部屏障，其脆弱性和敏感性仅次于眼皮，可谓牵一发而动全身，所以头皮出了问题，应该得到重视。
头皮最丰富的细菌品种应该是丙酸杆菌和葡萄球菌。这两个菌种彼此抑制平衡，同时影响着头皮屑的平衡。如果某一失衡被打破，头皮屑的生成机制就紊乱了，所以头皮屑就增多了。另外可能与银屑病等疾病有关。
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