怀孕40天流血多数有先兆流产的情况，需要去医院抽血做HCG、孕酮和妇科B超的检查。如果孕酮水平低，做妇科B超宫腔内孕囊发育符合停经天数，可以适当的卧床休息，给予黄体酮类的药物保胎治疗。治疗一周后若阴道流血停止，需要再次复查血HCG、孕酮和妇科B超。若妊娠囊发育良好，有胎心出现以后可以定期随访。如果做血HCG、孕酮偏低，妇科B超孕囊萎缩或定期随访没有胎心出现，也需要尽早给予终止妊娠，防止导致宫腔感染的情况发生。当女性在怀孕40天出现阴道流血，要尽早就医以免耽误治疗。
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