吡柔比星是抗肿瘤药，用药后会产生副作用。主要表现在骨髓抑制，骨髓抑制主要表现为粒细胞减少，像贫血以及血小板减少比较少见。心脏毒性，急性的心脏毒性主要表现为可逆性的心电图变化，如心律失常或者非特异性ST异常，慢性心脏毒性是呈剂量累积性的，也就是用药量越大，心脏毒性越大。
吡柔比星也像其它的抗肿瘤药一样也会产生脱发的副作用，有些患者会出现重度的脱发。吡柔比星还会产生胃肠道的副作用，如恶心、呕吐、食欲不振、口腔黏膜炎，有时还会出现腹泻。吡柔比星还会有可能出现肝肾功能异常、皮肤色素沉着，偶见皮疹，膀胱内注入可出现尿频、排尿痛等膀胱刺激症状，偶然也会出现血尿，极少数患者会有膀胱萎缩的症状。因此在用药时一定要注意观察，有异常表现应及时就诊。
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