乙肝携带者有胃病并不会影响任何治疗，可以根据胃病的情况对症治疗。乙肝携带者大部分人群都属于健康的携带者，没有肝功能的异常。如果出现了肝功能异常、肝炎的发作就需要口服抗病毒药物进行治疗。推荐的抗病毒治疗药物包括恩替卡韦及替诺福韦，能够有效的抑制乙肝病毒的复制，延缓肝纤维化、肝硬化的发展，并且降低肝癌的发生概率。
乙肝携带者在定期每半年的随访当中，如果没有出现肝炎、肝纤维化、肝硬化的情况，就属于健康的携带者。健康携带者由于肝功能正常，治疗任何疾病都不需要有特别的处理，可以进行胃病的治疗。
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