乙肝如果使用干扰素治疗，它的疗程是一个有限的疗程。先观察6个月，如果在第6个月的时候病毒量未见下降，考虑效果不佳，应该及时停药。如果病毒量出现明显的下降，可以延长至1年，1年满的时候如果病毒DNA已经转阴，伴有表面抗原数值大幅度下降，排除干扰素的禁忌后延长至2年。
如果超过2年还有继续使用的必要，建议先口服核苷类似物进行过渡，并停用干扰素0.5-1年，让身体得到充分休息后再恢复使用。不建议连续使用超过3年，因为长时间的使用干扰素，有可能会诱发免疫功能紊乱等副作用。
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