睡眠不足对神经系统、心血管系统、内分泌系统和消化系统影响比较大，长时间不睡眠还可以危及到生命。轻中度的睡眠不足可以有精神不振、记忆力下降等神经系统损伤，心血管系统则可以有心率增加、血压升高、心绞痛等改变。内分泌系统可以有交感神经兴奋、肾上腺素分泌增多，幼年期睡眠不足可以因为生长素分泌不足影响身高，女性可以诱发月经不调，此外消化系统会出现食欲不振等改变。
本身有肝脏疾病时，可以导致肝功能损伤加重，严重缺乏睡眠则会出现狂躁、心功能不全等改变。有研究显示，正常人超过5天不睡眠可以危及到生命，对生命的重要性介于饮水和饮食之间。
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