早晨咳嗽的原因较多，主要是晨起时，吸入的空气发生了温度变化，导致气道受到刺激发生咳嗽。
具体如下：
1、支气管哮喘：咳嗽常见于支气管哮喘，可以在晨起发生，也可以在夜间或凌晨发生。咳嗽属于阵发性干咳，即痰液较少的咳嗽。部分患者会伴有喘息的症状，部分患者会有共病，如过敏性鼻炎等；
2、过敏性疾病：如嗜酸粒细胞性支气管炎、变异性咳嗽均可导致早晨咳嗽；
3、慢性疾病：如慢性支气管炎、慢性阻塞性肺疾病等疾病，也可导致晨起咳嗽。
上述疾病常伴有咳痰的存在，夜间分泌物积聚在气管，即痰液积聚在气管，晨起时会出现排痰的现象。痰液需要通过咳嗽排出，所以出现咳嗽、咳痰的现象。
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