炎症性肠炎的病因是比较复杂的，到现在也没有明确的病因，还是综合诊断，所以也没有特别的治疗，都是综合治疗。目前比较明确的原因有自身免疫紊乱，所以它是一种自身免疫相关的疾病，自身免疫的紊乱，还有比较明确就是细菌的感染，有感染学说，正是基于原因，所以炎性肠病是跟菌群失调相关，在治疗上也会有一些合并的治疗。炎症性肠病是有遗传因素、家族聚集性，还有很多其他的一些学说就不太确定了。目前主要就是遗传学说、感染学说，还有自身免疫的相关性。
