对于心房颤动，合并心脏器质性的疾病，首先需要积极的处理心脏原发疾病，像冠心病、高血压、风湿性心脏病。另外，对于房颤最为应该注意的就是防止血栓的形成，甚至栓子的脱落，因此需要长期合理的抗凝治疗。对于左心房很容易形成血栓者，可以进行栓子的封堵，左心耳封堵术。另外，抗凝治疗可以应用华法林或者利伐沙班，应用华法林进行治疗的时候，需要检测按一按国际标准化比值，将国际标准化比值控制在2.0-3.0之间。同时，需要注意华法林的副作用就是出血，很容易出现口、鼻，甚至内脏出血。
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