脑囊虫病属于寄生虫感染，主要以药物治疗为主，比如：吡喹酮、丙硫咪唑。
用药过程中如出现颅内压增高可用糖皮质激素和甘露醇处理。
可应用内镜或开颅行囊虫摘除术。
对于脑实质内多发性囊虫因个数太多，无法全部摘除者，如果引起广泛脑水肿，并发颅内压增高，危及生命或影响视力而不能用药物控制时，根据颅内压增高程度可施行一侧或双侧颞肌下减压术。
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