肛门的疾病主要是良性疾病，具体的包括痔疮，详细的以齿状线为界分为内痔和外痔，而内痔和外痔合并存在称作混合痔。还有肛瘘以及肛周脓肿，属于肛周的感染性的疾病，也是感染的不同时期的临床表现。另外就是肛裂多继发于习惯性的便秘，典型的症状是排便时肛门疼痛，伴有排便带血。也有肛管乳头状瘤肥大，或者直肠息肉，都会出现排便带血的现象。还有就是发生于肛管的恶性肿瘤，病人会有明显的肛门疼痛，大便不成形，主要以鳞癌为多见。另外就是发生于肛周的皮肤的病变，像肛周湿疹以及肛周的恶性黑色素瘤，也是一种恶性度比较高的肿瘤。
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