功能性矫治器主要适用于口面肌肉功能异常所引起的功能性错(牙合)畸形。此外早期骨性错(牙合)，当促进正常的口面功能活动，能为颅面骨骼和牙(牙合)发育提供有利环境时，也可以使用；功能性矫治器最适宜青春生长并迸发期前1-2年开始，并持续整个迸发期。对于中国儿童，女性平均9-10岁、男性平均12-13岁进入青春迸发期。
从牙龄上考虑，功能性矫治器的主要使用对象为替牙期患者、乳牙期和恒牙早期也可以使用。当面部生长接近完成时，其疗效明显受限。功能性矫治器主要用于矫正长度不调，既用于安氏Ⅱ类错(牙合)，也可用于安氏Ⅲ类错(牙合)；错(牙合)功能性矫治器还可用于矫正高度不调，对深覆(牙合)效果较好，也用于开合。
此外，功能性矫治器可以用于后牙的高度不调，但不适用于牙列拥挤、牙齿错位及拔牙病例。如果需要可在功能性矫治器治疗之后，配合使用机械矫治器排齐牙齿。
