早上起来就胃痛与反流性食管炎、慢性胃炎、十二指肠溃疡等疾病有关。反流性食管炎的患者在晚上睡觉时，因为胃酸分泌过多，贲门位置比较高而食管部位相对比较低，因此更容易导致胃酸反流到食管黏膜，这时不仅会出现食管部位不适感，同时也会伴随有胃部疼痛。
慢性胃炎的患者在早上起床时，因为胃酸浓度过高，所以会对胃黏膜造成一定的侵犯，因此会伴随有胃部疼痛感。在早上起床时由于胃内没有食物存在，所以胃酸会在高强度的状态下排进到十二指肠中，一旦患有十二指肠溃疡疾病会因此出现胃部疼痛感，并且疼痛性质比较剧烈，甚至还会出现恶心、呕吐等症状。
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